Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC46.14■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCDC180Q9P1Z9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC46.13■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC46.12■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC46.1■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCDC180Q9P1Z9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC46.02■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC46.02■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
CCDC180Q9P1Z9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
CCDC180Q9P1Z9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms