Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
HCN3Q9P1Z3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms