Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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SH3BP4Q9P0V3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP4Q9P0V3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP4Q9P0V3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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