Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COX16Q9P0S2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX16Q9P0S2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms