Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD3Q9P035 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD3Q9P035 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms