Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
ARHGEF12Q9NZN5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF12Q9NZN5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms