Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRHL1Q9NZI5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRHL1Q9NZI5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRHL1Q9NZI5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms