Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPG21Q9NZD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPG21Q9NZD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPG21Q9NZD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms