Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC9

SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1Q9NZC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCAL1Q9NZC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCAL1Q9NZC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms