Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms