Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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