Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDE1Q9NXR1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms