Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT1Q9NXH9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT1Q9NXH9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms