Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms