Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms