Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms