Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms