Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC1Q9NRX5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC1Q9NRX5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms