Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms