Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms