Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms