Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms