Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBF2Q9HAK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms