Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR41Q9HAD4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR41Q9HAD4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR41Q9HAD4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms