Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms