Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms