Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARV1Q9H2C2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARV1Q9H2C2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms