Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM39BQ9GZU3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39BQ9GZU3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms