Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C20orf27Q9GZN8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C20orf27Q9GZN8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms