Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms