Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2OQ9C0C9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2OQ9C0C9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2OQ9C0C9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2OQ9C0C9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2OQ9C0C9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2OQ9C0C9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE2OQ9C0C9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms