Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEF2Q9C093 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEF2Q9C093 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEF2Q9C093 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEF2Q9C093 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEF2Q9C093 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEF2Q9C093 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEF2Q9C093 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEF2Q9C093 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms