Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDEM3Q9BZQ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms