Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms