Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL3Q9BXA9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms