Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms