Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C16orf70Q9BSU1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C16orf70Q9BSU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C16orf70Q9BSU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C16orf70Q9BSU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C16orf70Q9BSU1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C16orf70Q9BSU1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C16orf70Q9BSU1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C16orf70Q9BSU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms