Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms