Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms