Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms