Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA3Q99618 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms