Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOTCH4Q99466 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOTCH4Q99466 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOTCH4Q99466 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH4Q99466 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH4Q99466 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH4Q99466 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH4Q99466 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms