Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN3Q96TC7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN3Q96TC7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms