Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UHRF1Q96T88 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms