Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
IFT140Q96RY7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms