Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CAMKK2Q96RR4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMKK2Q96RR4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms