Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms