Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RILPQ96NA2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms