Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms