Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms